灵芝孢子粉初服者有便秘或排黑便现象属正常；个别肠胃不佳患者出现轻微腹泻现象，也属正常，待几日后可恢复。极个别人出现严重腹泻，应停止服用。
长期患病的人更要吃灵芝孢子粉。许多研究都证实：灵芝与西药有相辅相成的效果，可以较少的西药剂量，达到最佳的疗效，同时减少副作用的产生，减轻肝脏的负荷，保护体内正常细胞不受西药的伤害，以及缩短治疗的时间，增长寿命。
其整体效果均远比单吃灵芝孢子粉要来得好。例如：糖尿病、高血压、恶性肿瘤等重大疾病。当然，对于一般疾病，像感冒、过敏等，灵芝配合着西药吃，也都有加倍效果。总之灵芝和其它食品、药品一起服用基本上没禁忌，但是要是服用抗生素之类的药物最好间隔半个小时左右。
一、怎样服用灵芝孢子粉胶囊，才会最大程度发挥药用价值？灵芝孢子粉是一种亦药亦食的养生品，所以过多的服用，也不会起到任何副作用。胶囊剂型可以将有效物质--灵芝三萜直接送达消化系统，温开水有利于营养物质充分溶解，被人体有效吸收。用法用量：以知名品牌芝人堂灵芝孢子粉胶囊为例说明，日常保健：一次4粒，一天2次，饭前服用。辅助治疗：一次5粒，一天3次，饭前服用。二、为什么有的人反馈效果很好，有的人反馈效果一般？原因主要有二：1）灵芝类产品（包括灵芝孢子粉、灵芝孢子油）其中的核心有效成分为灵芝三萜，灵芝三萜含量多少直接决定了灵芝制剂的作用效果，这也是现代评测灵芝产品质量的核心指标。现代药理学对灵芝的药理作用研究已经证实：灵芝三萜确实有效。然而，灵芝产品在现实的应用中却褒贬不一，究其核心原因是：非专业灵芝制品企业单位，在灵芝菌种、仿野生种植、破壁加工等环节存在巨大差距，造成非专业灵芝制品中的灵芝三萜含量严重不足。直接影响了灵芝产品的功效。芝人堂灵芝孢子粉胶囊中的灵芝三萜含量达到5%。芝人堂灵芝孢子油采用国际上最先进的超临界CO2方法萃取，其中中灵芝三萜的含量更是达到了惊人的22.6%！2）有些人服用灵芝孢子粉时间很短，主观感觉没有想象中的效果，原因就是没有足量和较长时间坚持吃。老年人之所以信任孢子粉，是因为他们会坚持吃，而且灵芝孢子粉对病态体质效果会更明显。常感冒、口腔溃疡、头痛、口干喉痛、精力不足、睡眠质量差的朋友，只要你坚持吃，这些亚健康症状会从你身上消失。三、灵芝孢子粉会有副作用吗？灵芝是一类药食同源的中药，灵芝孢子粉是灵芝的种子，因此和灵芝是一样的，即是食品又是药品，其对疾病的作用机制是通过扶正固本，免疫调节实现，这一过程完全是正向的，因此即使长期服用通常也不会产生副作用。但部分人群会出现用药反应，中医叫瞑眩反应，又叫排毒反应，瞑眩反应是暂时的，随着持续服用，会逐渐减弱直至消失，所以出现反应并不影响继续服用。反而出现反应的，说明人体对灵芝是敏感的，是有效的。如有个别反应较大，可以改为饭后服用，或减量服用，待身体适应后，再按正常要求服用。
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